Los NIE y cambios en procedimiento:¡Es un problema!

Saludos a todos. Por la información que me va llegando nuestro sector sigue notando una fuerte demanada a pesar de la crisis. No debemos de quejarnos pero ha surgido un problema:
No sé si ocurre en las otras comunidades pero en Andalucía y Castilla La Mancha nos estamos encontrando con un gran problema en obtención de los NIE. Los profesores que van a solicitarlos están siendo informados que hay que hacer cita , y se está dando fechas de entre octubre y noviembre.
Parece ser que se puede iniciar el procedimiento "online" por lo que los profesores podrán adelantar la semana que viene sus solicitudes sobre todo los que empiezan en octubre.
Todos sabemos que se puede dar de alta al personal con sus números de pasaportes pero esto conlleva una cantidad enorme de problemas:
En la Seguridad Social es un lío cambiar al NIE después, Hacienda se hace un lío años después con la mezcla de NIE y número de pasaporte, los certificados de retenciones no co-inciden etc. Los bancos admiten abrir cuentas con pasaporte pero a las dos semanas se han dado casos donde "congelan" la cuenta hasta no tener el NIE, o obligan abrir una cuenta de no residentes.
No se sabe el origen de esta fastidiosa y absurda novedad, puede ser un tema de reciprocidad (suele serlo). Si alguien sabe más sobre este asunto o pueda aportar información por favor agregarlo a comentarios abajo por el bien de todos.
Richard